反滲透設備停機時間若大于48小時，可以采取以下程序進行系統的保存：

(1) 在所有的保存之前，系統需要清洗，清除所有沉積在膜表面的污染物和污垢(這項操作只用于膜元件受到污染或者預計受到污染的情況下采用)。在長期系統停機之前，使用建議的標準清洗程序和消毒程序。在成功完成清洗和消毒之后，要盡可能快的進行保存，距離最近一次的清洗/消毒時間間隔最大為12小時。

(2) 保存通過使用清洗系統的500-1,000ppm亞硫酸氫鈉溶液的循環來完成。通過這種方式，膜元件將在保存溶液中徹底濕潤。采用這種方式在整個系統中循環溶液，在二次循環完成以后(大約1個小時)就可以使剩余空氣量降低到最小。確保在保存期間系統中不含有空氣進行密封，并且氣密性好。

(3) 關閉供給端和鹽水端所有的閥。亞硫酸氫鈉溶液與外界空氣(氧氣)的任何接觸都將導致亞硫酸氫鈉被氧化成硫酸鹽，而且pH值會持續下降。在所有的亞硫酸氫鹽被消耗掉以后，剩余的氧氣將不會被吸收，那么生物的狀態就會變得不穩定。

(4) 被保存的反滲透系統的pH值需要定期調節(至少一個月一次) ，以保證溶液的pH值不會低于3。如果發現保存溶液的pH值低于3，那么必須更換保存溶液。保存溶液必須每個月更換一次。

(5) 在停機期間，存儲溫度不要超過35℃，但不要低于0℃，以防結凍。

(6) 也可采用質量百分比濃度為0.2-0.3%的甲醛溶液代替亞硫酸氫鈉作為保存溶液。甲醛是比亞硫酸氫納更強的微生物殺傷劑，并且組成中不含有氧。

注意：由于甲醛具有一定的毒性，所以使用甲醛時，一定要注意甲醛使用的安全規定；膜元件在用甲醛溶液進行保存以前，必須在正常條件使用至少24小時，否則可能會導致產水流量大大降。